RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PICALM	Q13492	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TDG	Q13569	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	F8	P00451	2351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TSC2	P49815	1807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281		E9PSI1	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MEIS1	O00470	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	NOBOX	O60393	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ENTPD3	O75355	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ITGB1	P05556	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TEC	P42680	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MTOR	P42345	2549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SLC28A2	O43868	658 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CABYR	O75952	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CYBB	P04839	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	RB1	P06400	928 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	FCER1A	P12319	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	NCAM1	P13591	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ATF2	P15336	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	VAV1	P15498	845 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	VCAM1	P19320	739 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MVK	Q03426	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	MPP2	Q14168	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	JAML	Q86YT9	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CARF	Q8N187	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	FGD4	Q96M96	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SIL1	Q9H173	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	TLE6	Q9H808	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281		F6X3S4	739 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	CLEC3A	O75596	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF205	O95201	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	ITPKB	P27987	946 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PRDX5	P30044	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	GDF5	P43026	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB18-205	ENST00000484281	PSMD2	Q13200	908 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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