RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ART4Q93070 314 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TMEM143Q96AN5 459 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TLCD1Q96CP7 247 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CDCA5Q96FF9 252 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 BICD1Q96G01 975 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PGM2Q96G03 612 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 RUFY1Q96T51 708 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 FMO2Q99518 471 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 AZI2Q9H6S1 392 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 WHRNQ9P202 907 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 GGA2Q9UJY4 613 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ADM5C9JUS6 153 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TP73O15350 636 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MAGEB2O15479 319 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CLDN3O15551 220 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TCEA3O75764 348 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 IL18RAPO95256 599 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CALB1P05937 261 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 WEE2P0C1S8 567 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 RARGP13631 454 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TNNI1P19237 187 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 OSBPP22059 807 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 RRM1P23921 792 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NF2P35240 595 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PIK3CAP42336 1068 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 IRAK1P51617 712 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 GYS2P54840 703 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CAV1Q03135 178 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MAMLD1Q13495 774 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NCOA4Q13772 614 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PTK6Q13882 451 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TFDP1Q14186 410 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 KCTD2Q14681 263 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SLMAPQ14BN4 828 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MAPK6Q16659 721 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TTC27Q6P3X3 843 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 EXD1Q8NHP7 514 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CXorf38Q8TB03 319 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 IFT81Q8WYA0 676 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CENPTQ96BT3 561 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 BCO2Q9BYV7 579 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 KATNBL1Q9H079 304 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 LHX5Q9H2C1 402 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 VTA1Q9NP79 307 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ACP6Q9NPH0 428 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PNMA3Q9UL41 463 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 FZD1Q9UP38 647 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PLAAQ9Y263 795 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PASKQ96RG2 1323 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MYO1FO00160 1098 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 THAP12O43422 761 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SPOPO43791 374 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 SORBS3O60504 671 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 PHACTR2O75167 634 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms