RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 MTRRQ9UBK8 725 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 ZNF233A6NK53 670 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 TGFB1I1O43294 461 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 PAPLNO95428 1278 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 CEP57Q86XR8 500 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 S1PR5Q9H228 398 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-203ENST00000474160 NCOR1O75376 2440 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TTC28Q96AY4 2481 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ANO9A1A5B4 782 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 H7C4K7 107 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 M0QZQ0 153 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 DLL1O00548 723 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 NFICP08651 508 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 IL9P15248 144 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 EPCAMP16422 314 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MCM4P33991 863 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MTHFRP42898 656 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 STK4Q13043 487 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MYBPC2Q14324 1141 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SAAL1Q96ER3 474 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 RMND1Q9NWS8 449 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PIRO00625 290 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PNPLA4P41247 253 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 BRCC3P46736 316 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SPAG1Q07617 926 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 RAB33AQ14088 237 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 CLUL1Q15846 466 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 LILRA6Q6PI73 481 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 B3GALT6Q96L58 329 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 VCANP13611 3396 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PDXKO00764 312 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SMC2O95347 1197 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TYMPP19971 482 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ZNF560Q96MR9 790 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 GSDMAQ96QA5 445 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 DPP3Q9NY33 737 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 MAFFQ9ULX9 164 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ANK1P16157 1881 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 VWA8A3KMH1 1905 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TGM5O43548 720 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 PRR29P0C7W0 189 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 LILRA4P59901 499 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 NFIL3Q16649 462 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ZNF280DQ6N043 979 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 DSEQ9UL01 958 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TNFRSF10AO00220 468 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D4O60343 1298 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 OAZ2O95190 189 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 POU2F2P09086 479 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 HOXA9P31269 272 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 TAF6P49848 677 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ZP2Q05996 745 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 UVSSAQ2YD98 709 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 GPR149Q86SP6 731 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 WDR49Q8IV35 697 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms