RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CTXN3Q4LDR2 81 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 BORCS6Q96GS4 357 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZNF197O14709 1029 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 GUCY2CP25092 1073 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 PRPHP41219 470 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SEZ6Q53EL9 994 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TIPINQ9BVW5 301 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.72■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SPTLC1O15269 473 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 NCAM2O15394 837 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TOM1L1O75674 476 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ADCY1Q08828 1119 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 GRM2Q14416 872 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZBTB44Q8NCP5 570 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 DDX12PQ92771 950 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 NELL1Q92832 810 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 DNASE1L2Q92874 299 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ASB16Q96NS5 453 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 KIF2CQ99661 725 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CEP72Q9P209 647 aa24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 MCM4P33991 863 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 STRN3Q13033 797 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 APPL2Q8NEU8 664 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MAFFQ9ULX9 164 aa24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MOSPD3O75425 235 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PLS3P13797 630 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 HYIQ5T013 277 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZNF280DQ6N043 979 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PNMA5Q96PV4 448 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 BRD9Q9H8M2 597 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.69■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MCL1Q07820 350 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 TWF1Q12792 350 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 IQCEQ6IPM2 695 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 TSSK4Q6SA08 328 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZPBP2Q6X784 338 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ELMOD1Q8N336 334 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 SMARCD2Q92925 531 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PATJQ8NI35 1801 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 CITO14578 2027 aa24.68■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 CLDN3O15551 220 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 LILRB5O75023 590 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 CXCL8P10145 99 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 SMTNP53814 917 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 EPHA5P54756 1037 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MTAPQ13126 283 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 VITQ6UXI7 678 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 SPTBN2O15020 2390 aa24.67■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 M0QZQ0 153 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 MAN2B1O00754 1011 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 OAZ2O95190 189 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 GJA1P17302 382 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 VIPR2P41587 438 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 SPAG1Q07617 926 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZBTB6Q15916 424 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 BEST2Q8NFU1 509 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 IRF7Q92985 503 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 PLIN2Q99541 437 aa24.66■■□□□ 1.54
USP4-208ENST00000464168 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
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