RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB7Q99436 277 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TINF2Q9BSI4 451 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 BCO2Q9BYV7 579 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ST7Q9NRC1 585 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 STIM2Q9P246 746 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SIX4Q9UIU6 781 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 SCN1AP35498 2009 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 CLDN3O15551 220 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RAD51CO43502 376 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ERLIN1O75477 346 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 C1QTNF8P60827 252 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 NKX3-2P78367 333 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 NCOA4Q13772 614 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HIC1Q14526 733 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 PEX26Q7Z412 305 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 CEP120Q8N960 986 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CAGE1Q8TC20 777 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GJD2Q9UKL4 321 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 AMFRQ9UKV5 643 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PASKQ96RG2 1323 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WZ62 844 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GUA9 196 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 H3BRB1 525 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN1O60635 241 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZMYND10O75800 440 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 IL18RAPO95256 599 aa6.04□□□□□ -1.44
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