RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 CLUHO75153 1309 aa30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 NFICP08651 508 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 CYP3A5P20815 502 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 ALCAMQ13740 583 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 POSTNQ15063 836 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 RESP18Q5W5W9 173 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 CYP26C1Q6V0L0 522 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 CD302Q8IX05 232 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 PLCD3Q8N3E9 789 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 STYXL1Q9Y6J8 313 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 H7C4K7 107 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 CCL16O15467 120 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 ADSSP30520 456 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 LRPAP1P30533 357 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 CTXN3Q4LDR2 81 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 APPL2Q8NEU8 664 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 SAAL1Q96ER3 474 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 FAM213AQ9BRX8 229 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 RCOR1Q9UKL0 485 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 DSTYKQ6XUX3 929 aa30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM67Q6ZTA4 783 aa30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 BLZF1Q9H2G9 400 aa30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 ZDHHC9Q9Y397 364 aa30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 PPEF2O14830 753 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 ADRB2P07550 413 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 CASP1P29466 404 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 AFMP43652 599 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 ROR1Q01973 937 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA1Q5VX52 437 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 HFE2Q6ZVN8 426 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 GLIS3Q8NEA6 775 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA32Q96LK8 384 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 TSPAN18Q96SJ8 248 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 PCIF1Q9H4Z3 704 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 PCDHB8Q9UN66 801 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 SORCS3Q9UPU3 1222 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA8IPA6NC78 632 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM221A6NGB7 291 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA8JA6NMD2 632 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 M0R296 226 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 KRT85P78386 507 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 MTMR3Q13615 1198 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF280DQ6N043 979 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 SMOC2Q9H3U7 446 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ASB7Q9H672 318 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM206Q9H813 350 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 MAGEF1Q9HAY2 307 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 FBXL5Q9UKA1 691 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 KCNH3Q9ULD8 1083 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 XYLBO75191 536 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ELF1P32519 619 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 CBWD1Q9BRT8 395 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 DERAQ9Y315 318 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 WDR27A2RRH5 827 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 PRRG1O14668 218 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 NTHL1P78549 312 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 SIGLEC14Q08ET2 396 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 BECN1Q14457 450 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 C9orf57Q5W0N0 161 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 SLC8B1Q6J4K2 584 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ARMCX5Q6P1M9 558 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 USP37Q86T82 979 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 MYADMQ96S97 322 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 C7orf25Q9BPX7 421 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ANK1P16157 1881 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 IL18RAPO95256 599 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 CPB1P15086 417 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 FAM26FQ5R3K3 315 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF461Q8TAF7 563 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 PBXIP1Q96AQ6 731 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 DPP3Q9NY33 737 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 SERTAD1Q9UHV2 236 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 C2CD2Q9Y426 696 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 M0QZQ0 153 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 LDHAP00338 332 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 GARTP22102 1010 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 FSHRP23945 695 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 UVSSAQ2YD98 709 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 EFCAB13Q8IY85 973 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-210ENST00000440825 CYP4F11Q9HBI6 524 aa30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms