RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PTPN4-204	ENST00000431283	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PTPN4-204	ENST00000431283	NACC2	Q96BF6	587 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPN4-204	ENST00000431283	AMY1A	P04745	511 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	RARRES1	P49788	294 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC16A1	P53985	500 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CACNA2D1	P54289	1103 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ACAP2	Q15057	778 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	GEN1	Q17RS7	908 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	DACT2	Q5SW24	774 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	NRG4	Q8WWG1	115 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	TMX3	Q96JJ7	454 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CTXN1	P60606	82 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ERVK-21	P61565	698 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF844	Q08AG5	666 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	LNX2	Q8N448	690 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SSH3	Q8TE77	659 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF384	Q8TF68	577 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	MKS1	Q9NXB0	559 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC78	A2IDD5	438 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	FPGS	Q05932	587 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	HDAC10	Q969S8	669 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CDYL	Q9Y232	598 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC151	A5D8V7	595 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283		K7ESF4	209 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	YY2	O15391	372 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ATP8B2	P98198	1209 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	TRIM75P	A6NK02	468 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	GRM6	O15303	877 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	FCER1A	P12319	257 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	FOLR3	P41439	243 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	WAS	P42768	502 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CDC42EP1	Q00587	391 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SLFN5	Q08AF3	891 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	KAZN	Q674X7	775 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	CNTD1	Q8N815	330 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	FBXL20	Q96IG2	436 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	INTS13	Q9NVM9	706 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PRAMEF10	O60809	474 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	NDUFS2	O75306	463 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	AGFG2	O95081	481 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB24	Q969Q5	203 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	KLK15	Q9H2R5	256 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	PCSK5	Q92824	1860 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PS29	197 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	TOR1B	O14657	336 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	MGST3	O14880	152 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	KCNA2	P16389	499 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	PIGF	Q07326	219 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	COLEC12	Q5KU26	742 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPN4-204	ENST00000431283	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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