RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBED4O75132 1171 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC4O95801 387 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ATF2P15336 505 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP24A1Q07973 514 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 NUGGCQ68CJ6 796 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO5Q75V66 913 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DCLK3Q9C098 648 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 O00370 1275 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GH1P01241 217 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTA1P08263 222 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PTK6Q13882 451 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PGM5Q15124 567 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GADL1Q6ZQY3 521 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD14AQ96MC6 490 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ANAPC5Q9UJX4 755 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP1Q9UPQ3 857 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP14Q460N5 1801 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR64B1ANS9 1081 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 UBOX5O94941 541 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GAS8O95995 478 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CLTAP09496 248 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 UNGP13051 313 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 FSTL1Q12841 308 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC2Q8TDI7 906 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 RLFQ13129 1914 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR162Q16538 588 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 AS3MTQ9HBK9 375 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 IRF6O14896 467 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1G2O95670 118 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 RALAP11233 206 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GJC1P36383 396 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MPP2Q14168 576 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP4X1Q8N118 509 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 NINJ2Q9NZG7 142 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 BRAFP15056 766 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE4CQ08493 712 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 WLSQ5T9L3 541 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D31Q96DN5 1066 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 BICD1Q96G01 975 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAIPQ9BWF2 469 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf112Q9NSG2 853 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKEF1Q9NU02 776 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.773e-16■■■■■ 31.7
SH3BP1-202ENST00000417536 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MYPNQ86TC9 1320 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5DP30049 168 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 JAK3P52333 1124 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF16Q5VV41 709 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 USP37Q86T82 979 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PRUNE1Q86TP1 453 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GPD1LQ8N335 351 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ATL2Q8NHH9 583 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MAIP1Q8WWC4 291 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP170P1Q96L14 293 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL18Q96ME1 805 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 NOD2Q9HC29 1040 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 OAS1P00973 400 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CETPP11597 493 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GCNT1Q02742 428 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PASD1Q8IV76 773 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MAN1A1P33908 653 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 NSFP46459 744 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 NEDD9Q14511 834 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GIMAP7Q8NHV1 300 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf72Q96LT7 481 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 HGSO14964 777 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ILDR2Q71H61 639 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF516Q92618 1163 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM8Q9UJA3 840 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 OTOFQ9HC10 1997 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SUN1O94901 812 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CFHP08603 1231 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF2H1P32780 548 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DSG3P32926 999 aa19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms