RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 TREHO43280 583 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIB2Q92519 343 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF653Q96CK0 615 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 SIX4Q9UIU6 781 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 CD58P19256 250 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 VSNL1P62760 191 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 PBKQ96KB5 322 aa23.08■■□□□ 1.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 ASB7Q9H672 318 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5-204ENST00000412806 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 ASPAP45381 313 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 BRD3Q15059 726 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 ACAP3Q96P50 834 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CISHQ9NSE2 258 aa23.08■■□□□ 1.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC151A5D8V7 595 aa23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 NPTXRO95502 500 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 MESDQ14696 234 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF394Q53GI3 561 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.04■■□□□ 1.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 USP38Q8NB14 1042 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.04■■□□□ 1.28
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