RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391218.1

RNU6-1250P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1250, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1250P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ABL2P42684 1182 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOP2P46087 812 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LUMP51884 338 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UCNP55089 124 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NDPQ00604 133 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FPGSQ05932 587 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GRIK2Q13002 908 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TUSC3Q13454 348 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MTX1Q13505 466 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AAMPQ13685 434 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MOGSQ13724 837 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SHBQ15464 509 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CNGA3Q16281 694 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GEN1Q17RS7 908 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SNAI3Q3KNW1 292 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM30BQ3MIR4 351 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 EMC4Q5J8M3 183 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM201Q5SNT2 666 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 WASHC2DQ5SRD0 308 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC25A30Q5SVS4 291 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DCST1Q5T197 706 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KRT79Q5XKE5 535 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 METRNLQ641Q3 311 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PLA2G4FQ68DD2 849 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM200BQ69YZ2 307 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TTLL5Q6EMB2 1281 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SWSAP1Q6NVH7 229 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DEF8Q6ZN54 512 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 USP53Q70EK8 1073 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 THNSL2Q86YJ6 484 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ERC1Q8IUD2 1116 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RIOX2Q8IUF8 465 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ANKMY2Q8IV38 441 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF440Q8IYI8 595 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LNX2Q8N448 690 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM199Q8N511 208 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TPRX1Q8N7U7 411 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF441Q8N8Z8 693 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ADCY4Q8NFM4 1077 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TRIM58Q8NG06 486 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SPATA20Q8TB22 786 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC7A14Q8TBB6 771 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LPIN2Q92539 896 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 STAMQ92783 540 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RITA1Q96K30 269 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC46A1Q96NT5 459 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FOXN4Q96NZ1 517 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SIGLEC11Q96RL6 698 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LITAFQ99732 161 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MACROD1Q9BQ69 325 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CABLES2Q9BTV7 478 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PRDM12Q9H4Q4 367 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KAT14Q9H8E8 782 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IL21RQ9HBE5 538 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM8AQ9HCN3 771 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GALNT9Q9HCQ5 603 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF304Q9HCX3 659 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MYOZ2Q9NPC6 264 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM86C1Q9NVL1 165 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GPR83Q9NYM4 423 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 POGKQ9P215 609 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SEPT3Q9UH03 358 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 USP25Q9UHP3 1055 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF229Q9UJW7 825 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FBXO10Q9UK96 956 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CYP8B1Q9UNU6 501 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HDAC5Q9UQL6 1122 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CSAG2Q9Y5P2 127 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AATKQ6ZMQ8 1374 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 EVPLQ92817 2033 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PCNX2A6NKB5 2137 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UMODL1Q5DID0 1318 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 268.5 ms