RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MTSS1O43312 755 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ATP4AP20648 1035 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 COPB2P35606 906 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SOX6P35712 828 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TXKP42681 527 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 POLE2P56282 527 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RAB14P61106 215 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF174Q15697 407 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 BBS5Q8N3I7 341 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PSTPIP2Q9H939 334 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 DCCP43146 1447 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SMIM23A6NLE4 172 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 H3BQF6 201 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GDF11O95390 407 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FAM200BP0CF97 657 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PPARAQ07869 468 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 AP3B2Q13367 1082 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CALCRLQ16602 461 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KRT24Q2M2I5 525 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 NSL1Q96IY1 281 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MMS19Q96T76 1030 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CCSER1Q9C0I3 900 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FANCLQ9NW38 375 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PSMD3O43242 534 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GSNP06396 782 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SERPINB5P36952 375 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SREBF2Q12772 1141 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 NECTIN1Q15223 517 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KRT31Q15323 416 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TRIM50Q86XT4 487 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CALML6Q8TD86 181 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SGF29Q96ES7 293 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 WDR64B1ANS9 1081 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 AP1G2O75843 785 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 IL18RAPO95256 599 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PDGFRBP09619 1106 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TRPC1P48995 793 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CSNK2BP67870 215 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PSMD6Q15008 389 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RPS6KA2Q15349 733 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MAPK11Q15759 364 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SETD9Q8NE22 299 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CYP39A1Q9NYL5 469 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF532Q9HCE3 1301 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 BTBD18B2RXH4 712 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KCNK3O14649 394 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CHEK2O96017 543 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KRT7P08729 469 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GRK3P35626 688 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ADCY8P40145 1251 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PLA2G4AP47712 749 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 BFSP1Q12934 665 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PDIA5Q14554 519 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 NAB2Q15742 525 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TXNRD1Q16881 649 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ARCQ7LC44 396 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 EPB41L5Q9HCM4 733 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ROBO3Q96MS0 1386 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 DENND3A2RUS2 1198 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 BUB1O43683 1085 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KRT20P35900 424 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GRAPQ13588 217 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FUKQ8N0W3 1084 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms