RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378778.5

PTPRR-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-203ENST00000378778 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 LENG9Q96B70 501 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF653Q96CK0 615 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 GSC2O15499 205 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CLDN3O15551 220 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CREB3O43889 395 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KCNA3P22001 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ATP2B4P23634 1241 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PTPN7P35236 360 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 VAMP7P51809 220 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 BPIFB4P59827 614 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PSMC6P62333 389 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 RCN2Q14257 317 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TMED2Q15363 201 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CHADLQ6NUI6 762 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 AAGABQ6PD74 315 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CCDC174Q6PII3 467 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CENPUQ71F23 418 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CYP4X1Q8N118 509 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 EXD1Q8NHP7 514 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 FIZ1Q96SL8 496 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 AMNQ9BXJ7 453 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 GMEB1Q9Y692 573 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 F5H6K3 240 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 MEIS2O14770 477 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KLF11O14901 512 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ALOX15BO15296 676 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ATP9AO75110 1047 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 FKBP6O75344 327 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KLRC2P26717 231 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KCNJ1P48048 391 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 IRX4P78413 519 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PPARDQ03181 441 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 DNAJC3Q13217 504 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ITPK1Q13572 414 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ITGA9Q13797 1035 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 EFHC2Q5JST6 749 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 AADACL2Q6P093 401 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PALB2Q86YC2 1186 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ACCSQ96QU6 501 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 HAPLN3Q96S86 360 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 NYAP2Q9P242 653 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 NARFQ9UHQ1 456 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 GYG2O15488 501 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PDHA1P08559 390 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 MAPK4P31152 587 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 STAT3P40763 770 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 RFC5P40937 340 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 FMO1Q01740 532 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 MCL1Q07820 350 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 GRAPQ13588 217 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 PRR16Q569H4 304 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-203ENST00000378778 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms