RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 FITM2Q8N6M3 262 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SLC5A5Q92911 643 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 HAPLN3Q96S86 360 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM260Q9NX78 707 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 WDR27A2RRH5 827 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 VWC2LB2RUY7 222 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 IL2P60568 153 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PPP3CAQ08209 521 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PGBD1Q96JS3 809 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PADI4Q9UM07 663 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF10O60809 474 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PER3P56645 1201 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 ADRM1Q16186 407 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SOGA3Q5TF21 947 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 ALAS1P13196 640 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 MPGP29372 298 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf74Q86VG3 221 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 H3BNC9 293 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 PPEF2O14830 753 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 ENPP1P22413 925 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A9P48067 706 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 RAX2Q96IS3 184 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TLR10Q9BXR5 811 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-202ENST00000367364 INSIG1O15503 277 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PPP3CBP16298 524 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 KCNA2P16389 499 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 FAM153CQ494X1 144 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM140Q9NV12 185 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 TEX33O43247 280 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CD1AP06126 327 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 DRD4P21917 467 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 FPGSQ05932 587 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 MTM1Q13496 603 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SEPT2Q15019 361 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 GREM2Q9H772 168 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 TARM1B6A8C7 271 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CERS1P27544 350 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 NR4A2P43354 598 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PROSER3Q2NL68 480 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 AMY1AP04745 511 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A4P31645 630 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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