RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L5A8MUK1 530 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 USP17L12C9JPN9 530 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L21D6R901 530 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SCYL1Q96KG9 808 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
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