RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 DPP7Q9UHL4 492 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.25■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 WEE2P0C1S8 567 aa16.24■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.23■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.23■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.23■□□□□ 0.19
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PTPRO-202ENST00000348962 NCAM1P13591 858 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SPATC1LQ9H0A9 340 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 APRTP07741 180 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 GPC2Q8N158 579 aa16.22■□□□□ 0.19
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