RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CTSAP10619 480 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 STX17P56962 302 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CXCL14O95715 111 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 VAMP7P51809 220 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 DPCR1Q3MIW9 517 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1841Q6NSI8 718 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 GPR65Q8IYL9 337 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 EEF2KMTQ96G04 330 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CHST7Q9NS84 486 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 IRAK3Q9Y616 596 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 PNPLA4P41247 253 aa28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 RBP5P82980 135 aa28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 FAM171A1Q5VUB5 890 aa28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf127Q8N9H9 656 aa28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ANO10Q9NW15 660 aa28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 VWA8A3KMH1 1905 aa28.89■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 ITGB3P05106 788 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 URODP06132 367 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 IRS1P35568 1242 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 GLUD2P49448 558 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 LILRA4P59901 499 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 BFSP1Q12934 665 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHO2Q8TD55 490 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 BORCS6Q96GS4 357 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 SUSD3Q96L08 255 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF560Q96MR9 790 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 TTPALQ9BTX7 342 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 AGAP1Q9UPQ3 857 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRJQ12913 1337 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 GNA14O95837 355 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 BRCC3P46736 316 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 DSG1Q02413 1049 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PLPP4Q5VZY2 271 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PDXDC1Q6P996 788 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC52Q8N7C0 313 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF516Q92618 1163 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CSPG5O95196 566 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 KRT19P08727 400 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 FGFR3P22607 806 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 TAF6P49848 677 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 DLG4P78352 724 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 STX1AQ16623 288 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 FRMD5Q7Z6J6 570 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CEP57Q86XR8 500 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM130Q8N3G9 435 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CXorf38Q8TB03 319 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF37A1IGU5 675 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf71A6NGG8 1288 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 M0QZQ0 153 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PPEF2O14830 753 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 SYN3O14994 580 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 STX10O60499 249 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CA8P35219 290 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 MYO1EQ12965 1108 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 NFKBIBQ15653 356 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 SV2CQ496J9 727 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 DSTYKQ6XUX3 929 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 SIX4Q9UIU6 781 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 LILRB3O75022 631 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PHACTR2O75167 634 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2H1P32780 548 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CREMQ03060 361 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN14Q15678 1187 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 APPL2Q8NEU8 664 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 TLE6Q9H808 572 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-201ENST00000330233 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms