RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 TUBP50607 506 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CENPCQ03188 943 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 NR1H3Q13133 447 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 PDK4Q16654 411 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 VSIG1Q86XK7 387 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TDRPQ86YL5 185 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 NIM1KQ8IY84 436 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ATL2Q8NHH9 583 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SEMA4DQ92854 862 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TEKT1Q969V4 418 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 GMCL1Q96IK5 515 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.02□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM196BA6NMK8 535 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 F5H6K3 240 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 K7ENM7 598 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 KLRC2P26717 231 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 EPHB2P29323 1055 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ADCY8P40145 1251 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MXI1P50539 228 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 PTP4A2Q12974 167 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TMED2Q15363 201 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC142Q17RM4 750 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 BBOF1Q8ND07 529 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 HELQQ8TDG4 1101 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ASB3Q9Y575 518 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP3K13O43283 966 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SPAG7O75391 227 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 RAD17O75943 681 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 UPP2O95045 317 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 NPTXRO95502 500 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CBX6O95503 412 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 NDUFB10O96000 172 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ADRB2P07550 413 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 FGFR1P11362 822 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 VPS41P49754 854 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SPARCL1Q14515 664 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 LONP2Q86WA8 852 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TTC8Q8TAM2 541 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM136AQ96C01 138 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC77Q9BR77 488 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM206Q9H813 350 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.01□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SPDYE5A6NIY4 337 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TYROBPO43914 113 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 GAS7O60861 476 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ENTPD5O75356 428 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 FDX1P10109 184 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MAPK4P31152 587 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGEA4P43358 317 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CRKP46108 304 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 MFAP3P55082 362 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ALCAMQ13740 583 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CCNG2Q16589 344 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 TATDN1Q6P1N9 297 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC89Q8N998 374 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 JDP2Q8WYK2 163 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 ZBTB10Q96DT7 871 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 SYT15Q9BQS2 421 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 LXNQ9BS40 222 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXP3Q9BZS1 431 aa9□□□□□ -0.97
UBQLN3-201ENST00000311659 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms