RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.56■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 THAP12O43422 761 aa25.56■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PPFIA4O75335 1185 aa25.56■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 CFHP08603 1231 aa25.56■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.56■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.56■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 ATP1A2P50993 1020 aa25.55■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 C2CD6Q53TS8 623 aa25.55■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 WDR78Q5VTH9 848 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.55■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 VCPIP1Q96JH7 1222 aa25.55■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PARP2Q9UGN5 583 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.55■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 CENPHQ9H3R5 247 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 MROH8Q9H579 483 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 ABLIM1O14639 778 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 FSCN2O14926 492 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PROSCO94903 275 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SLC26A2P50443 739 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SURF1Q15526 300 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SCINQ9Y6U3 715 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PASKQ96RG2 1323 aa25.54■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PDCLQ13371 301 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 FAM212AQ96EL1 285 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC19Q9H756 370 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 TFDP1Q14186 410 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.53■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.53■■□□□ 1.68
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TRIM54-201ENST00000296098 SGO2Q562F6 1265 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 COPS5Q92905 334 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.52■■□□□ 1.68
TRIM54-201ENST00000296098 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 PROZP22891 400 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 MYL6P60660 151 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 PTP4A2Q12974 167 aa25.51■■□□□ 1.67
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TRIM54-201ENST00000296098 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.51■■□□□ 1.67
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TRIM54-201ENST00000296098 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 NLRP4Q96MN2 994 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 SPON1Q9HCB6 807 aa25.51■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
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TRIM54-201ENST00000296098 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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TRIM54-201ENST00000296098 KCNJ1P48048 391 aa25.5■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.5■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 TTLL4Q14679 1199 aa25.5■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.5■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.5■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.5■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 ACKR2O00590 384 aa25.49■■□□□ 1.67
TRIM54-201ENST00000296098 TRPC3Q13507 836 aa25.49■■□□□ 1.67
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