RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CCNFP41002 786 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ARFIP2P53365 341 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 STK32AQ8WU08 396 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 HEY2Q9UBP5 337 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 LZTS1Q9Y250 596 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 B2RBV5 119 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PEX10O60683 326 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PHF2O75151 1096 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ABL2P42684 1182 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 LIG4P49917 911 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 KCTD2Q14681 263 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PPP2R5DQ14738 602 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 Q3C1V9 767 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 FAM20AQ96MK3 541 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CD58P19256 250 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ABCD1P33897 745 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SCFD2Q8WU76 684 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 IDI2Q9BXS1 227 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PREBQ9HCU5 417 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 AKAP3O75969 853 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CALCAP01258 141 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 VHLP40337 213 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 NT5C2P49902 561 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ANO7Q6IWH7 933 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CCDC125Q86Z20 511 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CFLARO15519 480 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 CYP26A1O43174 497 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 FGRP09769 529 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 SOX5P35711 763 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 GPC5P78333 572 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ALG3Q92685 438 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 STAMBPO95630 424 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PYGMP11217 842 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 MCL1Q07820 350 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 NPY5RQ15761 445 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 AGR3Q8TD06 166 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 LRRC15Q8TF66 581 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 GGA2Q9UJY4 613 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 KAT6AQ92794 2004 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 ESYT2A0FGR8 921 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTC1-201ENST00000290378 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms