RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 RESP18Q5W5W9 173 aa20.55■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.55■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.55■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 MAFFQ9ULX9 164 aa20.55■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 C8AP07357 584 aa20.54■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 ELF1P32519 619 aa20.54■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 ACOT2P49753 483 aa20.54■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 ZNF280DQ6N043 979 aa20.54■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.54■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 M0QZQ0 153 aa20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 ADAM12O43184 909 aa20.53■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 ADSSP30520 456 aa20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D4O60343 1298 aa20.52■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 CASP5P51878 434 aa20.52■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.52■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 UNC13DQ70J99 1090 aa20.52■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 NXPE3Q969Y0 559 aa20.52■□□□□ 0.88
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA32Q96LK8 384 aa20.52■□□□□ 0.88
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MALSU1-201ENST00000287543 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.51■□□□□ 0.87
MALSU1-201ENST00000287543 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.51■□□□□ 0.87
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MALSU1-201ENST00000287543 PIRO00625 290 aa20.5■□□□□ 0.87
MALSU1-201ENST00000287543 EXTL3O43909 919 aa20.5■□□□□ 0.87
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MALSU1-201ENST00000287543 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
MALSU1-201ENST00000287543 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
MALSU1-201ENST00000287543 POLIQ9UNA4 740 aa20.49■□□□□ 0.87
MALSU1-201ENST00000287543 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.49■□□□□ 0.87
MALSU1-201ENST00000287543 UBE4BO95155 1302 aa20.49■□□□□ 0.87
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