RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.64□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB21Q9UL25 225 aa7.64□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PNMA2Q9UL42 364 aa7.64□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.64□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.64□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 EVPLQ92817 2033 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MYMKA6NI61 221 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 HIDE1A8MVS5 230 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FSCN2O14926 492 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS3O15072 1205 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CETN3O15182 167 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 AKR1B10O60218 316 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 GNAT1P11488 350 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP3A7P24462 503 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP25P42331 645 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT7BP56706 349 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 USP46P62068 366 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM17P78536 824 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SKOR1P84550 965 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR93Q6P2C0 686 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM20AQ96MK3 541 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PNMA5Q96PV4 448 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CHP1Q99653 195 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF25Q9BQ70 676 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 AMNQ9BXJ7 453 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF14Q9UBS8 474 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 COL4A3Q01955 1670 aa7.63□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TDP2O95551 362 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G4BP0C869 781 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PRLRP16471 622 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 GAP43P17677 238 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA13P27216 316 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MARK3P27448 753 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PAFAH1B1P43034 410 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G4AP47712 749 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ITIH3Q06033 890 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CES5AQ6NT32 575 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 DYMQ7RTS9 669 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ANO3Q9BYT9 981 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MED4Q9NPJ6 270 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP72Q9P209 647 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 DNM3Q9UQ16 869 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MYH11P35749 1972 aa7.62□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FRYQ5TBA9 3013 aa7.61□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.61□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP2K7O14733 419 aa7.61□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 OPLAHO14841 1288 aa7.61□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PJA2O43164 708 aa7.61□□□□□ -1.19
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