RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PYGMP11217 842 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PCK1P35558 622 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PRKCEQ02156 737 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PPP3CAQ08209 521 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 GPS1Q13098 491 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 P3H1Q32P28 736 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CGRRF1Q99675 332 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 RARAP10276 462 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SLC8A3P57103 927 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZNF699Q32M78 642 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DPH6Q7L8W6 267 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ATP2A3Q93084 1043 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 VCXQ9H320 206 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NAMPTP43490 491 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ARSEP51690 589 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MAPK6Q16659 721 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TRABDQ9H4I3 376 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC18Q9H819 358 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 H7C0C1 242 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FSCN2O14926 492 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PLSCR1O15162 318 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CCND1P24385 295 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MMP13P45452 471 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ATP5OP48047 213 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PSMD6Q15008 389 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PASD1Q8IV76 773 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PRELID2Q8N945 189 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TLCD1Q96CP7 247 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 OPLAHO14841 1288 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SPAG6O75602 509 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DRD4P21917 467 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ1P48048 391 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MTMR2Q13614 643 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NCOA4Q13772 614 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TAS1R2Q8TE23 839 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CSADQ9Y600 493 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZWINTO95229 277 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 RALAP11233 206 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KYNUQ16719 465 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ATG16L1Q676U5 607 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SV2AQ7L0J3 742 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CHST13Q8NET6 341 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 STRCQ7RTU9 1775 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NEBLO76041 1014 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MORF4L2Q15014 288 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 LRRC14Q15048 493 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 E2F5Q15329 346 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MFSD5Q6N075 450 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB33Q86T24 672 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PIM2Q9P1W9 311 aa9.36□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 HESX1Q9UBX0 185 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms