RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 TC2NQ8N9U0 490 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 KAT5Q92993 513 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.74■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 INPPL1O15357 1258 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 UPP2O95045 317 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 CYP3A5P20815 502 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 KRT9P35527 623 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 RBP5P82980 135 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 GRIK3Q13003 919 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 BAP1Q92560 729 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 IQCDQ96DY2 449 aa24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 EPHB4P54760 987 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 DEFB103AP81534 67 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ANO9A1A5B4 782 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 GSDMDP57764 484 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 CNGA4Q8IV77 575 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ABI1Q8IZP0 508 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 URGCPQ8TCY9 931 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 HPDLQ96IR7 371 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ARID3AQ99856 593 aa24.72■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 COL4A6Q14031 1691 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 LRRC53A6NM62 1247 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 LRPAP1P30533 357 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ZBED6P86452 979 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 ZNF365Q70YC5 407 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 RABGGTAQ92696 567 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 CASD1Q96PB1 797 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.71■■□□□ 1.55
USF2-201ENST00000222305 PIRO00625 290 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 BAIAP3O94812 1187 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 AMHP03971 560 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 RFX1P22670 979 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 PDXDC1Q6P996 788 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 SPAG5Q96R06 1193 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 POLIQ9UNA4 740 aa24.7■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 B4GALT3O60512 393 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 EFCAB14O75071 495 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 CAPN15O75808 1086 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 FGBP02675 491 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 ATICP31939 592 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 CLCNKBP51801 687 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 JAM2P57087 298 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 TAF4BQ92750 862 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.542e-8■■■■□ 20.9
USF2-201ENST00000222305 GPR88Q9GZN0 384 aa24.69■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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USF2-201ENST00000222305 ZBBXA8MT70 800 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 HOXA2O43364 376 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 DDHD2O94830 711 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 MFAP3P55082 362 aa24.68■■□□□ 1.54
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USF2-201ENST00000222305 TUSC3Q13454 348 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 CUL2Q13617 745 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 TOP1MTQ969P6 601 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 STK33Q9BYT3 514 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 F8VZ95 297 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 PODXLO00592 558 aa24.68■■□□□ 1.54
USF2-201ENST00000222305 KCNJ6P48051 423 aa24.68■■□□□ 1.54
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