RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.52■■□□□ 1.36
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HTATSF1-201ENST00000218364 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS41P49754 854 aa23.52■■□□□ 1.36
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HTATSF1-201ENST00000218364 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.52■■□□□ 1.36
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HTATSF1-201ENST00000218364 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.51■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 CEP83Q9Y592 693 aa23.51■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 RASA4O43374 803 aa23.5■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.5■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 CCNE2O96020 404 aa23.49■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 GARTP22102 1010 aa23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 GCAP28676 217 aa23.49■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.49■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF516Q92618 1163 aa23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 CNTNAP1P78357 1384 aa23.48■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 NFASCO94856 1347 aa23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP9AO75110 1047 aa23.47■■□□□ 1.35
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