RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100237.3

Ttf1-201, Transcript of Transcription termination factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ttf1, Length 4,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1-201ENSMUST00000100237 FignQ9ERZ6 759 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sucla2Q9Z2I9 463 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slit1Q80TR4 1531 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt90E9Q1Z0 538 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CraddO88843 199 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GfapP03995 430 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 TxnP10639 105 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Hmx2P43687 273 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 SqleP52019 572 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 MafbP54841 323 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Stx2Q00262 289 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Q3V0E1 1183 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Adamts18Q4VC17 1219 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Shc3Q61120 474 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lilrb4Q64281 335 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Adat2Q6P6J0 191 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rnf208Q8K0W3 265 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dppa3Q8QZY3 150 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Plcb4Q91UZ1 1175 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nek8Q91ZR4 698 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cmtm5Q9D6G9 156 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gadd45gQ9Z111 159 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sult3a2G5E904 293 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PtprcP06800 1291 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Edem3Q2HXL6 931 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm3414Q3TNU4 584 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tigd5Q499M4 642 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ubn1Q4G0F8 1135 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp341Q6PGC9 846 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mageb18Q8BQR7 327 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mettl24Q8CCB5 363 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 OtoaQ8K561 1137 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Scrn2Q8VCA8 425 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Smap1Q91VZ6 440 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Eif3hQ91WK2 352 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Thumpd2Q9CZB3 528 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mms19Q9D071 1031 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 ToporslQ9D2F8 683 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tgm5Q9D7I9 724 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IkbipQ9DBZ1 373 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rbp7Q9EPC5 134 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt17Q9QWL7 433 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfyve9A2A8R0 1397 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Itga9B8JK39 1036 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm5926E9PWJ8 236 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 5830473C10RikF8VQ07 620 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fgl2P12804 432 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 ZfxP17012 799 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mgat1P27808 447 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lrch1P62046 709 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 OtulinQ3UCV8 352 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mylk3Q3UIZ8 795 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Parp3Q3ULW8 533 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Olfm4Q3UZZ4 505 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pla2g4cQ64GA5 597 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 RubcnQ80U62 956 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp8Q80U87 1080 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Q8R1Y2 203 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CpzQ8R4V4 654 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nmrk1Q91W63 195 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trex1Q91XB0 314 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nsmce3Q9CPR8 279 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 LrmdaQ9D9B4 229 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gdap2Q9DBL2 498 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Caln1Q9JJG7 219 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rnf4Q9QZS2 194 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ric1Q69ZJ7 1422 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 AtrnQ9WU60 1428 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tbc1d25A1A5B6 742 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp984A2A7A2 547 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Per2O54943 1257 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IkbkgO88522 412 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Phkg1P07934 388 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ncam1P13595 1115 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Srek1ip1Q4V9W2 153 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Efr3bQ6ZQ18 817 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tmc4Q7TQ65 694 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 RimklbQ80WS1 387 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gprasp2Q8BUY8 826 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ces4aQ8R0W5 563 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Otud7aQ8R554 926 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Klrb1fQ8VD98 217 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gpsm2Q8VDU0 679 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 MlphQ91V27 590 aa7.25□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Syt17Q920M7 470 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.7 ms