RNA–Protein interactions for RNA: YOL078W

AVO1, Transcript of Component of a membrane-bound complex containing the Tor2p kinase, yeast

Gene AVO1, Length 3,531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO1	YOL078W	AVT5	P38176	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	UBP5	P39944	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	CRZ1	P53968	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	BCH1	Q05029	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	FAR7	P43592	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	BIR1	P47134	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	ORM1	P53224	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	ARN2	P38724	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	GCN3	P14741	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	HYM1	P32464	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	SOL2	P37262	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	PEX22	P39718	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	PGD1	P40356	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	ILM1	P47155	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	MRX8	Q05473	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	OSW1	Q08692	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	MRPL9	P31334	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	RIM2	P38127	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	CDC7	P06243	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	GPA2	P10823	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	EPT1	P22140	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	COX13	P32799	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	PAC10	P48363	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	SPG4	Q04438	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	YBR063C	P38083	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	DOG2	P38773	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	CCC1	P47818	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	HEM25	Q07534	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVO1	YOL078W	CDC50	P25656	391 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	HRT3	Q12347	344 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YCR100C	P25606	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	VPS25	P47142	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	FMN1	Q03778	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	FYV7	Q12247	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	PRR2	Q12310	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	FCY2	P17064	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	CNB1	P25296	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	AHC2	P25649	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	PMU1	P36069	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	AIM39	Q08223	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ERG4	P25340	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
AVO1	YOL078W	UBC7	Q02159	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	SEC22	P22214	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YMC1	P32331	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	EFM1	P38732	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YER186C	P40101	306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	PAN6	P40459	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	FLC3	P53121	802 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YGR050C	P53231	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	RNH201	P53942	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	INP1	Q03694	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	HCM1	P25364	564 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	BXI1	P48558	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	AVT4	P50944	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	PFA4	Q12006	378 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ERD1	P16151	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	LDB16	P25587	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YBR220C	P38318	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ORC5	P50874	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	IES4	Q08561	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	MRP49	P32388	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	YBR056W	P38081	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	RFC2	P40348	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	FMP48	P53233	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	TIM18	Q08749	192 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	ATO3	Q12359	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AVO1	YOL078W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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