RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FIG1	P38224	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YGL117W	P53133	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CGR1	P53188	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YGR026W	P53217	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	NRG1	Q03125	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MET3	P08536	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SPS4	P09937	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MRS4	P23500	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CLB6	P32943	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	POP8	P38208	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
AMD1	YML035C	YFL051C	P43552	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TFC7	Q12415	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CDC34	P14682	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	URA6	P15700	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	HNM1	P19807	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	AGA2	P32781	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MCH2	P36032	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PIG2	P40187	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YIL029C	P40538	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SKP1	P52286	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FYV6	P53913	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PEX4	P29340	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YND1	P40009	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	BMT5	P40493	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PHO23	P50947	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GIM3	P53900	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YML018C	Q03730	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	IFM1	P25038	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FAT1	P38225	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TOK1	P40310	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YDC1	Q02896	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	REP2	P03872	296 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SAG1	P20840	650 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SRB6	P32570	121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YBR220C	P38318	560 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FLX1	P40464	311 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PRM4	Q12498	284 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GAL1	P04385	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	PUT1	P09368	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	EGT2	P42835	1041 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	AGX1	P43567	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	GWT1	P47026	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	YNL092W	P53934	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	GRC3	Q07845	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	HUT1	Q12520	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	CPR4	P25334	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	YCR101C	P25607	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	RFC2	P40348	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	ODC1	Q03028	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	SNO1	Q03144	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	SCP1	Q08873	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
AMD1	YML035C	MED4	Q12343	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	MSI1	P13712	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	FMT1	P32785	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	YGL015C	P33199	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMD1	YML035C	SWM2	P40342	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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