RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF410	Q86VK4	478 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ALG3	Q92685	438 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HGH1	Q9BTY7	390 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LZTS1	Q9Y250	596 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHD4	Q14839	1912 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PODXL	O00592	558 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAGEC1	O60732	1142 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TCEA3	O75764	348 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHRNB2	P17787	502 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLCG1	P19174	1290 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP1R2	P41236	205 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRAPPC10	P48553	1259 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BCAP31	P51572	246 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MECOM	Q03112	1051 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT72	Q14CN4	511 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NACC2	Q96BF6	587 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GAN	Q9H2C0	597 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HEY2	Q9UBP5	337 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP21	Q9UK80	565 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TECPR2	O15040	1411 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLRF2	D3W0D1	207 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADCY6	O43306	1168 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBC1D12	O60347	775 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC4	O95801	387 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP6V1B1	P15313	513 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PEX2	P28328	305 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHRNA3	P32297	505 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CETN2	P41208	172 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBA7	P41226	1012 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CPA2	P48052	419 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BORA	Q6PGQ7	559 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMC7	Q7Z402	723 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EYA2	O00167	538 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CD48	P09326	243 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EPS15	P42566	896 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NPEPPS	P55786	919 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OVGP1	Q12889	678 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPARCL1	Q14515	664 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TLR1	Q15399	786 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CYTH1	Q15438	398 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		9.24	□□□□□ -0.93

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