RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D4O60343 1298 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ABLIM3O94929 683 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 RHOP08100 348 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MCF2P10911 925 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK7Q13164 816 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 IL17AQ16552 155 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A9Q2M3M2 681 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 RINT1Q6NUQ1 792 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ACAP3Q96P50 834 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf75Q9HAS0 396 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 GDE1Q9NZC3 331 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 LAD1O00515 517 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 CDC25AP30304 524 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ID4P47928 161 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 TCHPQ9BT92 498 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 CNTN3Q9P232 1028 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 WDR27A2RRH5 827 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 SYN3O14994 580 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ECI2O75521 394 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 RPL9P32969 192 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 PRPHP41219 470 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 POTEHQ6S545 545 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MPZL3Q6UWV2 235 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK18Q7Z418 384 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MCRS1Q96EZ8 462 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 KIF2CQ99661 725 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 OSBPL6Q9BZF3 934 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA1AO00555 2505 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 COL4A3Q01955 1670 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ATF2P15336 505 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN2P17706 415 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ELF1P32519 619 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ERMP1Q7Z2K6 904 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL8Q8IYN2 117 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 BCO2Q9BYV7 579 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 FANCMQ8IYD8 2048 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 FAM170BA6NMN3 283 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 SFI1A8K8P3 1242 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 H7C4K7 107 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 PRRG1O14668 218 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A4O15374 487 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 LRG1P02750 347 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 UBXN2BQ14CS0 331 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 TIPINQ9BVW5 301 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 NUB1Q9Y5A7 615 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 MIA3Q5JRA6 1907 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 DNAH14Q0VDD8 3507 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRF-216ENST00000617451 CEBPBP17676 345 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 GUCY2CP25092 1073 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ARPP19P56211 112 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SPIRE2Q8WWL2 714 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 CYP4F11Q9HBI6 524 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 LTB4R2Q9NPC1 389 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL5Q9UKA1 691 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 CITO14578 2027 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 GPR179Q6PRD1 2367 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TOM1L1O75674 476 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SEC24AO95486 1093 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 HARSP12081 509 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 CD72P21854 359 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS36Q5K4E3 855 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TPGS2Q68CL5 300 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TANGO2Q6ICL3 276 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SUSD3Q96L08 255 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 CORO1BQ9BR76 489 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 STRN3Q13033 797 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SLC10A6Q3KNW5 377 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF528Q3MIS6 628 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ELSPBP1Q96BH3 223 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO4Q9UKT5 387 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 INSL5Q9Y5Q6 135 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 LAMTOR5O43504 91 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 MICAL2O94851 1124 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 PLS3P13797 630 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA9P43362 315 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.954e-9■■□□□ 13.3
PTPRF-216ENST00000617451 CTXN3Q4LDR2 81 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 HYIQ5T013 277 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TPRG1Q6ZUI0 275 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN23Q96B33 292 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL4Q96EI5 215 aa27.23■■□□□ 1.95
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