RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 RTL10Q7L3V2 364 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ING5Q8WYH8 240 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 PNMA5Q96PV4 448 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 TIPINQ9BVW5 301 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR27A2RRH5 827 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 STARD6P59095 220 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 HYIQ5T013 277 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 PJA1Q8NG27 643 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLIN2Q99541 437 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 KXD1Q9BQD3 176 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYN3O14994 580 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBC1D4O60343 1298 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABLIM3O94929 683 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 RHOP08100 348 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLS3P13797 630 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLULP15104 373 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 STRN3Q13033 797 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEZ6Q53EL9 994 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADSSL1Q8N142 457 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIF3AQ9Y496 699 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRN2O75325 713 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 TOM1L1O75674 476 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARPP19P56211 112 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 RABEP1Q15276 862 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 POTEHQ6S545 545 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 SHDQ96IW2 340 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-208ENST00000616074 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRG1P02750 347 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATF2P15336 505 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELF1P32519 619 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC12A3P55017 1021 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 R4GN57 208 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PATJQ8NI35 1801 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF292O60281 2723 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 FRYLO94915 3013 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 H7C4K7 107 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRRG1O14668 218 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEC24AO95486 1093 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLA2G4BP0C869 781 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEBPBP17676 345 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCM4P33991 863 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMTNP53814 917 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 SUSD3Q96L08 255 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CXCL8P10145 99 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPN2P17706 415 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 GJB2P29033 226 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PFKPQ01813 784 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKCQQ04759 706 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCL1Q07820 350 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZPBP2Q6X784 338 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMX3Q96JJ7 454 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDE1Q9NZC3 331 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCND2Q9NZV8 630 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-208ENST00000616074 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.68■■□□□ 1.22
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