RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611174.4

CENPE-208, Transcript of centromere protein E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CENPE, Length 8,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPE-208ENST00000611174 RABGAP1LQ5R372 815 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 FBXL16Q8N461 479 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 KIF2BQ8N4N8 673 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 DAGLBQ8NCG7 672 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 USP33Q8TEY7 942 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 UVRAGQ9P2Y5 699 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PXDNLA1KZ92 1463 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 GYG2O15488 501 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SLITRK3O94933 977 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 EFNA5P52803 228 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 FAM117BQ6P1L5 589 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 LCA5Q86VQ0 697 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 METTL23Q86XA0 190 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TPCN2Q8NHX9 752 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 LRRC37BQ96QE4 947 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 HIF1AQ16665 826 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 FIGNQ5HY92 759 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 LRRC43Q8N309 656 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CDC26Q8NHZ8 85 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 VPS39Q96JC1 886 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 HAUS2Q9NVX0 235 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CLGNO14967 610 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CHUKO15111 745 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 DIAPH2O60879 1101 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PIAS1O75925 651 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TAF11Q15544 211 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 KIZQ2M2Z5 673 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 DACT2Q5SW24 774 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 C2orf69Q8N8R5 385 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SPATA18Q8TC71 538 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 DTX3LQ8TDB6 740 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SCFD2Q8WU76 684 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 HAS1Q92839 578 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 ACAP3Q96P50 834 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 STAP1Q9ULZ2 295 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PIK3C2BO00750 1634 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TMEM120BA0PK00 339 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CHN1P15882 459 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 SLC8A1P32418 973 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 GARSP41250 739 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 GNASQ5JWF2 1037 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 BEST2Q8NFU1 509 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 MMP19Q99542 508 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 MTMR12Q9C0I1 747 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TRABDQ9H4I3 376 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 IP6K2Q9UHH9 426 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TBX20Q9UMR3 447 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 NEU2Q9Y3R4 380 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CEP152O94986 1710 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 VCAM1P19320 739 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PMLP29590 882 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 AP1B1Q10567 949 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 FUT2Q10981 343 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 VCXQ9H320 206 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 PARVAQ9NVD7 372 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 ZFATQ9P243 1243 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 MAPK13O15264 365 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 NPTXRO95502 500 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CYP2C9P11712 490 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 HSD17B3P37058 310 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 CDH8P55286 799 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 IL1RL1Q01638 556 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-208ENST00000611174 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms