RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCTP09848 1927 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0B4J269 797 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTMR3Q13615 1198 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MOB2Q70IA6 237 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCD1P33897 745 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNFSF9P41273 254 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CUL2Q13617 745 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM212AQ96EL1 285 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARIH2O95376 493 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSPA6P17066 643 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZDHHC24Q6UX98 284 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCHPQ9BT92 498 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIGRP01833 764 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EDNRBP24530 442 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ENPEPQ07075 957 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNX1Q13596 522 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEDD9Q14511 834 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CGRRF1Q99675 332 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADCY3O60266 1144 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RFC5P40937 340 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SULF1Q8IWU6 871 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPFIA2O75334 1257 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNA15P30679 374 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NF2P35240 595 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRT71Q3SY84 523 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GJB6O95452 261 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BPIFB4P59827 614 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCOA4Q13772 614 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPATCH11Q8N954 259 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM81BQ96LP2 452 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AZI2Q9H6S1 392 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SHBGP04278 402 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLTAP09496 248 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ODF2Q5BJF6 829 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR78Q5VTH9 848 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 METTL7BQ6UX53 244 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 O00370 1275 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 THAP12O43422 761 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CST3P01034 146 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PMS2P54278 862 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF677Q86XU0 584 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNMDO75829 334 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GJB1P08034 283 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LSP1P33241 339 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CENPCQ03188 943 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms