RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 PDXKO00764 312 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 HSPA6P17066 643 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 SCNN1BP51168 640 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 PLTPP55058 493 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 BNIP1Q12981 228 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 DYDC2Q96IM9 177 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.35□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.35□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.35□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.35□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 PJA2O43164 708 aa6.34□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 STAT2P52630 851 aa6.34□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.34□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 EYA4O95677 639 aa6.34□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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SEH1L-210ENST00000592582 NDC80O14777 642 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 SREBF1P36956 1147 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 SEC13P55735 322 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 MCL1Q07820 350 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.49e-54■■■■□ 21.3
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SEH1L-210ENST00000592582 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.34□□□□□ -1.4
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SEH1L-210ENST00000592582 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 MYCT1Q8N699 235 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 MARVELD3Q96A59 401 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.34□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
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SEH1L-210ENST00000592582 UBE4BO95155 1302 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 WDR81Q562E7 1941 aa6.33□□□□□ -1.4
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SEH1L-210ENST00000592582 NDUFB10O96000 172 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 STAT1P42224 750 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 CBX3Q13185 183 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 POTEBQ6S5H4 581 aa6.33□□□□□ -1.4
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.33□□□□□ -1.4
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