RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 AXLP30530 894 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CASP5P51878 434 aa25.76■■□□□ 1.71
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGRP01833 764 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 DSC3Q14574 896 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ZPBP2Q6X784 338 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ABI1Q8IZP0 508 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF19AQ9NV58 838 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 FANCMQ8IYD8 2048 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD8Q9HCK8 2581 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCE3A1L190 88 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMA7O14818 248 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SP9P0CG40 484 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 EPCAMP16422 314 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP6P22004 513 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CA8P35219 290 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 TYRO3Q06418 890 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 KRBA1A5PL33 1030 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 RFX1P22670 979 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PRCPP42785 496 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 AMHR2Q16671 573 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ISM2Q6H9L7 571 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR149Q86SP6 731 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM228AQ86W67 206 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC51Q96ER9 411 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CHST12Q9NRB3 414 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 IRAK3Q9Y616 596 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ST3GAL2Q16842 350 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-214ENST00000592483 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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CAPNS1-214ENST00000592483 PDXKO00764 312 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 NARSO43776 548 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN1O60635 241 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CAVIN2O95810 425 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CFHP08603 1231 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 BICD1Q96G01 975 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 BICDL2A1A5D9 508 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 N4BP3O15049 544 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 LIG4P49917 911 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 NOTUMQ6P988 496 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS52Q8N1B4 723 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.7■■□□□ 1.7
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CAPNS1-214ENST00000592483 TSG101Q99816 390 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
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CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D17Q9HA65 648 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 BAHCC1Q9P281 2608 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 TOM1L1O75674 476 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNE1P24864 410 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXD13P35453 343 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF445P59923 1031 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC63Q05C16 580 aa25.69■■□□□ 1.7
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