RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	STAT6	P42226	847 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF131	P52739	623 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCL1	Q07820	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDILT	Q8N807	584 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPTLC2	O15270	562 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLTA	P09496	248 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CXCL8	P10145	99 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FGFR3	P22607	806 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNFSF9	P41273	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	NUBP1	P53384	320 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX12P	Q92771	950 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYMK	A6NI61	221 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAM12	O43184	909 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASGR2	P07307	311 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	IDE	P14735	1019 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR1D2	P34982	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTF2B	Q00403	316 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A087X0B3	334 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TISP43	B9A030	160 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	OGT	O15294	1046 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP6R2	O75170	966 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZMYND10	O75800	440 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	F13A1	P00488	732 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIGR	P01833	764 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCP2	P22307	547 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABCD1	P33897	745 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCM4	P33991	863 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ID4	P47928	161 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARPP19	P56211	112 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KYAT1	Q16773	422 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	STAM	Q92783	540 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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