RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 AK2P54819 239 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CHST3Q7LGC8 479 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 DPF3Q92784 378 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 VWCEQ96DN2 955 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF146Q9NTX7 359 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PLXNB2O15031 1838 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ASB14A6NK59 587 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ARVCFO00192 962 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT4O43236 478 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MT-CO1P00395 513 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SMARCA1P28370 1054 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 NTF4P34130 210 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ADCY1Q08828 1119 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAF1Q13077 416 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT32Q14532 448 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC9A5Q14940 896 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPV1Q8NER1 839 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SHISA4Q96DD7 197 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 NEK1Q96PY6 1258 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K14Q99558 947 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC69A6NI79 296 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 B4DLN1 442 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01387J3KSC0 135 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 REC8O95072 547 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CYBAP13498 195 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 HALP42357 657 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 LIFRP42702 1097 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ANTXR2P58335 489 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTN2Q02246 1040 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TROAPQ12815 778 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ACVR2BQ13705 512 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GALEQ14376 348 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GRM4Q14833 912 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 USP53Q70EK8 1073 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 NACC1Q96RE7 527 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CPVLQ9H3G5 476 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PFASO15067 1338 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PMM2O15305 246 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SETSIPP0DME0 302 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CALM1P0DP23 149 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CALM2P0DP24 149 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CALM3P0DP25 149 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC25BP30305 580 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF5BP33176 963 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms