RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 CNTN3Q9P232 1028 aa16.32■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TSKSQ9UJT2 592 aa16.32■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.32■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.32■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 RCCD1A6NED2 376 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 PHACTR2O75167 634 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CHRNA1P02708 482 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP27A1Q02318 531 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CUL2Q13617 745 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 XKR4Q5GH76 650 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SIX4Q9UIU6 781 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NAGPAQ9UK23 515 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SQORQ9Y6N5 450 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.31■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 KBTBD13C9JR72 458 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 DNM1LO00429 736 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 FANCGO15287 622 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 KRT86O43790 486 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM212AQ96EL1 285 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ARID3AQ99856 593 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CHST12Q9NRB3 414 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.3■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF5CO60282 957 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 RPS6KA5O75582 802 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 RECQL4O94761 1208 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ATICP31939 592 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 MAGEA1P43355 309 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF132P52740 706 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 MYL6P60660 151 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF5AQ12840 1032 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NAB2Q15742 525 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF699Q32M78 642 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF18AQ8NI77 898 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 AGPAT1Q99943 283 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 INTUQ9ULD6 942 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CENPFP49454 3210 aa16.29■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ABL1P00519 1130 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CTSHP09668 335 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 KCNE1P15382 129 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 THPOP40225 353 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ASPAP45381 313 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 PDE6CP51160 858 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 GNG11P61952 73 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TRPC3Q13507 836 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ZBTB6Q15916 424 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 USP38Q8NB14 1042 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 BCO2Q9BYV7 579 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SNTG2Q9NY99 539 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM10Q9UDY6 481 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 IPPQ9Y573 584 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 PCNTO95613 3336 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 NCANO14594 1321 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 ARVCFO00192 962 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 GPR182O15218 404 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP26A1O43174 497 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP11B1P15538 503 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CDR2Q01850 454 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-214ENST00000589769 SCARA3Q6AZY7 606 aa16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms