RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 STK3Q13188 491 aa24.01■■□□□ 1.43
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CAPNS1-205ENST00000588780 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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CAPNS1-205ENST00000588780 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.01■■□□□ 1.43
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CAPNS1-205ENST00000588780 PMLP29590 882 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-205ENST00000588780 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-205ENST00000588780 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-205ENST00000588780 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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CAPNS1-205ENST00000588780 E2F7Q96AV8 911 aa23.94■■□□□ 1.42
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