RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 RFPL2O75678 378 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCL8P10145 99 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 BRCC3P46736 316 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NAB2Q15742 525 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LIN9Q5TKA1 542 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SFR1Q86XK3 245 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PDILTQ8N807 584 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX21Q969T3 373 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CHST7Q9NS84 486 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 STK17AQ9UEE5 414 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 DPP7Q9UHL4 492 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 POLIQ9UNA4 740 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 VWA8A3KMH1 1905 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 DENND4AQ7Z401 1863 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR33A8MZF0 331 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ABLIM1O14639 778 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ASGR2P07307 311 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 IDEP14735 1019 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PROZP22891 400 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 MCM4P33991 863 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TNFSF9P41273 254 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ARPP19P56211 112 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZPBP2Q6X784 338 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 SV2BQ7L1I2 683 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR149Q86SP6 731 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 UROC1Q96N76 676 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TBX20Q9UMR3 447 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAPPC3O43617 180 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 EFEMP2O95967 443 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 DDIT3P35638 169 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 MCL1Q07820 350 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC39A14Q15043 492 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPN21Q16825 1174 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 UPP1Q16831 310 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 EDAQ92838 391 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 CNTN3Q9P232 1028 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 FNIP2Q9P278 1114 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 CLUHO75153 1309 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A087X0B3 334 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM221A6NGB7 291 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 MYMKA6NI61 221 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 TISP43B9A030 160 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 M0R296 226 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 SPTLC2O15270 562 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 CCL16O15467 120 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAM12O43184 909 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 GCNT3O95395 438 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 BRD1O95696 1058 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 CLTAP09496 248 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNE1P15382 129 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 OR1D2P34982 312 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 GUCY2FP51841 1108 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF131P52739 623 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZXDAP98168 799 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms