RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928		E7EVH7	732 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	VNN1	O95497	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CXCL9	Q07325	125 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SEPT6	Q14141	434 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	PCYT2	Q99447	389 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CIT	O14578	2027 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC188	H7C350	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZBED4	O75132	1171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	KRT13	P13646	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SP2	Q02086	613 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MYLK	Q15746	1914 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	VWA5A	O00534	786 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	PROZ	P22891	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ARID5A	Q03989	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	KAT5	Q92993	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SFI1	A8K8P3	1242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CA8	P35219	290 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ART4	Q93070	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CENPT	Q96BT3	561 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MIS12	Q9H081	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CLIC2	O15247	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	TCEA3	O75764	348 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	PICK1	Q9NRD5	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CLTA	P09496	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	KRT35	Q92764	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	KRT38	O76015	456 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	KRT14	P02533	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	TGFB2	P61812	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-208	ENST00000587928	EPAS1	Q99814	870 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms