RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ADAM2	Q99965	735 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	NUP160	Q12769	1436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	KIF21B	O75037	1637 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	POMC	P01189	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ADH4	P08319	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SLC6A4	P31645	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	BMPR1A	P36894	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DPT	Q07507	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MED25	Q71SY5	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	NDUFA10	O95299	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CFI	P05156	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SBK3	P0C264	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	LAG3	P18627	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GCSH	P23434	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	HMGA2	P52926	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CTXN1	P60606	82 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DSC2	Q02487	901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	COL10A1	Q03692	680 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SCAP	Q12770	1279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GLI2	P10070	1586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	OVOL3	O00110	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	FOXN1	O15353	648 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TEX33	O43247	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SGTA	O43765	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ABHD16A	O95870	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PROZ	P22891	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SLC16A1	P53985	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	OCA2	Q04671	838 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	KAT5	Q92993	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PRRX2	Q99811	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	TGFB2	P61812	414 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	NOMO3	P69849	1222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	TLE1	Q04724	770 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX11-208	ENST00000576084	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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