RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557623.5

SLIRP-211, Transcript of SRA stem-loop interacting RNA binding protein, human

TSL 2 BASIC

Gene SLIRP, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLIRP-211	ENST00000557623	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	ZNF202	O95125	648 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	KIF4A	O95239	1232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	ADRB2	P07550	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	CASP1	P29466	404 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	TNFSF9	P41273	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	CLCNKB	P51801	687 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	DSG1	Q02413	1049 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	CREM	Q03060	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	PSMD2	Q13200	908 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	UPP1	Q16831	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	CASP10	Q92851	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLIRP-211	ENST00000557623	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	TISP43	B9A030	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623		F8W810	466 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	LINC01565	O15544	149 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	LILRB3	O75022	631 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	B3GAT3	O94766	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	CYP3A5	P20815	502 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ADSS	P30520	456 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	LTBR	P36941	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ACOT2	P49753	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ASB7	Q9H672	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24	4e-7	■■□□□ 12.6
SLIRP-211	ENST00000557623	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	DERA	Q9Y315	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	REV3L	O60673	3130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	PODXL	O00592	558 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	C2CD2L	O14523	706 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KLRC4	O43908	158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	TBX10	O75333	385 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	IL18RAP	O95256	599 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	GLP2R	O95838	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	BMP1	P13497	986 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KLRC2	P26717	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KCNQ1	P51787	676 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KCNC3	Q14003	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	EXTL3	O43909	919 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	C1R	P00736	705 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	ADH1A	P07327	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	LRPAP1	P30533	357 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLIRP-211	ENST00000557623	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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