RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZBTB39	O15060	712 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NCAM2	O15394	837 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TSPAN1	O60635	241 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	MAGEA9	P43362	315 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SOX9	P48436	509 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	XKR3	Q5GH77	459 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	LIN9	Q5TKA1	542 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TCEAL3	Q969E4	200 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	BORCS6	Q96GS4	357 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NELL2	Q99435	816 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	STK39	Q9UEW8	545 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222		K7ESF4	209 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	B4GALT5	O43286	388 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TADA2A	O75478	443 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	KIF4A	O95239	1232 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	KCNK5	O95279	499 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	YEATS4	O95619	227 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CCNE1	P24864	410 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PSMD5	Q16401	504 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RNF149	Q8NC42	400 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TTC8	Q8TAM2	541 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FAM3C	Q92520	227 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	COL26A1	Q96A83	441 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RAB34	Q9BZG1	259 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RGL1	Q9NZL6	768 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CFAP45	Q9UL16	551 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		15.21	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ECI2	O75521	394 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SLITRK3	O94933	977 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	RHO	P08100	348 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CHRNB1	P11230	501 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	GJA1	P17302	382 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	OR1D2	P34982	312 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	VIPR2	P41587	438 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CCR2	P41597	374 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CXCL12	P48061	93 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PSMC5	P62195	406 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	FOXC1	Q12948	553 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	STPG1	Q5TH74	334 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	DYDC2	Q96IM9	177 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	BRD9	Q9H8M2	597 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	COL4A2	P08572	1712 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PP2D1	A8MPX8	630 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LRP3	O75074	770 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	NPTXR	O95502	500 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	GDI1	P31150	447 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	NRL	P54845	237 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CDC42EP1	Q00587	391 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	GRIN1	Q05586	938 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	RING1	Q06587	406 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	STK38	Q15208	465 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CEP68	Q76N32	757 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	C4orf19	Q8IY42	314 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ERMN	Q8TAM6	284 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LXN	Q9BS40	222 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PARP2	Q9UGN5	583 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	USP20	Q9Y2K6	914 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	STK24	Q9Y6E0	443 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		15.19	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms