RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RFC5P40937 340 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 SEMA3AQ14563 771 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TTC34A8MYJ7 566 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 MTMR3Q13615 1198 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 IST1P53990 364 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-210ENST00000551525 CYTH1Q15438 398 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CEP55Q53EZ4 464 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CES5AQ6NT32 575 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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