RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 FPGSQ05932 587 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 IKBKEQ14164 716 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SURF1Q15526 300 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMEM240Q5SV17 173 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KRT39Q6A163 491 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GJB7Q6PEY0 223 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ZNF365Q70YC5 407 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMC6Q7Z403 805 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DPF3Q92784 378 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KAT5Q92993 513 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -14e-7■■□□□ 13
CS-216ENST00000549221 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GANQ9H2C0 597 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DERAQ9Y315 318 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PQC6 194 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 F8W810 466 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 STX10O60499 249 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DDHD2O94830 711 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 UPP2O95045 317 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 EOMESO95936 686 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GYPCP04921 128 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ITGB3P05106 788 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TPM2P07951 284 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PFKMP08237 780 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PIK3CAP42336 1068 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 MYL6P60660 151 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 LRMPQ12912 555 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -11e-7■■□□□ 12.1
CS-216ENST00000549221 BIRC3Q13489 604 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NCOA4Q13772 614 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GBP6Q6ZN66 633 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 USP37Q86T82 979 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CD302Q8IX05 232 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 HACE1Q8IYU2 909 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SPC24Q8NBT2 197 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RABGGTAQ92696 567 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TATDN2Q93075 761 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PGBD4Q96DM1 585 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CASD1Q96PB1 797 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RAB20Q9NX57 234 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DPP3Q9NY33 737 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.79□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SCN1AP35498 2009 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ANO9A1A5B4 782 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SPTLC1O15269 473 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 P4HA2O15460 535 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TNNC2P02585 160 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DSC1Q08554 894 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GRIK3Q13003 919 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ARID5BQ14865 1188 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.78□□□□□ -1
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