RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGKQ92643 395 aa11.33□□□□□ -0.6
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCKDHBP21953 392 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 10.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CIITAP33076 1130 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRCC3P46736 316 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMC5P62195 406 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMAN2Q12907 356 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMS2CLQ68D20 193 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.29□□□□□ -0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.29□□□□□ -0.6
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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