RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 SLC16A4O15374 487 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 NEBLO76041 1014 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 LYPLA2O95372 231 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 VPS41P49754 854 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 IZUMO3Q5VZ72 239 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 RGS9BPQ6ZS82 235 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC127Q96BQ5 260 aa12.23□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 KLRC2P26717 231 aa12.23□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 NR1H3Q13133 447 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 MOGSQ13724 837 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 DACT2Q5SW24 774 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 STRIP1Q5VSL9 837 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF365Q70YC5 407 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 TRABD2AQ86V40 505 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.23□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 TMC2Q8TDI7 906 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 ACER1Q8TDN7 264 aa12.23□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 CHKBQ9Y259 395 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 TMX2Q9Y320 296 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 MYPNQ86TC9 1320 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.456e-7■□□□□ 9.8
PTPRK-217ENST00000524534 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 PROSCO94903 275 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 FDX1P10109 184 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 GTF2H1P32780 548 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 LMNB2Q03252 620 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 TMED2Q15363 201 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 CEP128Q6ZU80 1094 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 PRUNE1Q86TP1 453 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 TDRPQ86YL5 185 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 SLC17A8Q8NDX2 589 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 SAAL1Q96ER3 474 aa12.22□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.22□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 CALCAP01258 141 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 NPR1P16066 1061 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 GNAZP19086 355 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 GCNT1Q02742 428 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 SETDB1Q15047 1291 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 CHURC1Q8WUH1 139 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 INPP5DQ92835 1189 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.22□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 FBXL18Q96ME1 805 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.451e-15■□□□□ 9.9
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PTPRK-217ENST00000524534 TBX20Q9UMR3 447 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.22□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 TOM1O60784 492 aa12.21□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 SV2AQ7L0J3 742 aa12.21□□□□□ -0.45
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PTPRK-217ENST00000524534 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF677Q86XU0 584 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 MAP4K3Q8IVH8 894 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 KATNAL2Q8IYT4 538 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 OGFOD1Q8N543 542 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 CPA5Q8WXQ8 436 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 OSBPL8Q9BZF1 889 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRK-217ENST00000524534 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
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