RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-208ENST00000522399 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 FGF13Q92913 245 aa27■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ODF2LQ9ULJ1 636 aa27■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 CA14Q9ULX7 337 aa27■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 KRBA1A5PL33 1030 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 PI15O43692 258 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 GFRA3O60609 400 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 MCL1Q07820 350 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 SLC8B1Q6J4K2 584 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 MTSS1LQ765P7 747 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 BRAPQ7Z569 592 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 GPR152Q8TDT2 470 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 BICD1Q96G01 975 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 H7C4K7 107 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 SCP2P22307 547 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ELF1P32519 619 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 NCKAP1LP55160 1127 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ROR1Q01973 937 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 PROB1E7EW31 1015 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 SEZ6Q53EL9 994 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ARSHQ5FYA8 562 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 HAUS6Q7Z4H7 955 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 GPBP1Q86WP2 473 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ITFG1Q8TB96 612 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 FGF14Q92915 247 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 VPS13AQ96RL7 3174 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 PRRG1O14668 218 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 LRG1P02750 347 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 CLTAP09496 248 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 MCM4P33991 863 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 PARM1Q6UWI2 310 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 DTWD2Q8NBA8 298 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 KCNN1Q92952 543 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 SUSD3Q96L08 255 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 REEP2Q9BRK0 252 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 TBC1D17Q9HA65 648 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ARHGEF3Q9NR81 526 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 NOTCH4Q99466 2003 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC13-208ENST00000522399 ABLIM3O94929 683 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 FAM13AO94988 1023 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 CXCL8P10145 99 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 NBL1P41271 181 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 LIG4P49917 911 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ARPP19P56211 112 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 KYAT1Q16773 422 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 APPL2Q8NEU8 664 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 WDR27A2RRH5 827 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ATF2P15336 505 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ZNF280DQ6N043 979 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 MYCT1Q8N699 235 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PARVGQ9HBI0 331 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 K7ENM7 598 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TBC1D4O60343 1298 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PPP2R3AQ06190 1150 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TPGS2Q68CL5 300 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 HAPLN2Q9GZV7 340 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 CYP4F11Q9HBI6 524 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TBX20Q9UMR3 447 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 CFAP54Q96N23 3096 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TTC26A0AVF1 554 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 RHOP08100 348 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PTPN2P17706 415 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PLCG1P19174 1290 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ABCD1P33897 745 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ZNF131P52739 623 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 GPC5P78333 572 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms