RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521189.1

CLVS1-207, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-207ENST00000521189 FANK1Q8TC84 345 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 MARVELD3Q96A59 401 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 BTBD6Q96KE9 485 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 FRMD6Q96NE9 622 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 USP28Q96RU2 1077 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NEURL2Q9BR09 285 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 OR51B5Q9H339 312 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 AFF2P51816 1311 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 RAD51BO15315 384 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 MYBL1P10243 752 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 PRKAR1AP10644 381 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 GAP43P17677 238 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ATP6V1E1P36543 226 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 VPS41P49754 854 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 RAD23BP54727 409 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 RAD51Q06609 339 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF33BQ06732 778 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SLFN13Q68D06 897 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TTC6Q86TZ1 520 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NELFBQ8WX92 580 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 BIRC8Q96P09 236 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 MARCH7Q9H992 704 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NTN4Q9HB63 628 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SNRKQ9NRH2 765 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CACNG2Q9Y698 323 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SMARCA4P51532 1647 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 RGS12O14924 1447 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 FANCGO15287 622 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 BCAR3O75815 825 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 INMTO95050 263 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CTNNA2P26232 953 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 EPHB4P54760 987 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NPTX1Q15818 432 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 DPP9Q86TI2 863 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 NME9Q86XW9 330 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ARL8AQ96BM9 186 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 WDR24Q96S15 920 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 SH2D4AQ9H788 454 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 MED16Q9Y2X0 877 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 PLA2R1Q13018 1463 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 A0A087WZG4 1122 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 A0A1B0GWJ7 208 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 A6NCN8 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF862O60290 1169 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CLN5O75503 358 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TPBGLP0DKB5 382 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TYK2P29597 1187 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 KRT2P35908 639 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 ADCY7P51828 1080 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 CCDC58Q4VC31 144 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-207ENST00000521189 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms