RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 COPS5Q92905 334 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KAT5Q92993 513 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SYNCQ9H7C4 482 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RAB20Q9NX57 234 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 USTQ9Y2C2 406 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PEX14O75381 377 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FECHP22830 423 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PASD1Q8IV76 773 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAM167AQ96KS9 214 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PNKPQ96T60 521 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ESYT3A0FGR9 886 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMOD1P28289 359 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GUCY2FP51841 1108 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2BQ00403 316 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SP2Q02086 613 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PPARDQ03181 441 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC38Q502W7 563 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM270Q6UE05 265 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 METTL7BQ6UX53 244 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SV2AQ7L0J3 742 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BSNDQ8WZ55 320 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM221A6NGB7 291 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LYPLA2O95372 231 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ADRB2P07550 413 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CLCN3P51790 818 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HDAC4P56524 1084 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 Q3C1V9 767 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SCFD2Q8WU76 684 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AGPAT1Q99943 283 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MYPNQ86TC9 1320 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SH3BP5O60239 455 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RGS20O76081 388 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GNAT1P11488 350 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PSMD7P51665 324 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TFDP1Q14186 410 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP7Q8WX94 980 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 THAP12O43422 761 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF9O75901 435 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK-9P63128 1117 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 C2CD6Q53TS8 623 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PACS1Q6VY07 963 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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